Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF2Q96GP6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms