Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA7LQ96GN5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA7LQ96GN5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms