Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4CQ96DT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms