Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RUNDC1Q96C34 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms