Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms