Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NKD2Q969F2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms