Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMTQ93088 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms