Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRG4Q92954 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms