Protein–RNA interactions for Protein: Q92841

DDX17, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX17Q92841 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX17Q92841 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX17Q92841 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms