Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACER1Q8TDN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms