Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO3Q8TAP4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO3Q8TAP4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms