Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HELBQ8NG08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HELBQ8NG08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms