Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYRIPQ8NFW9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms