Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms