Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGBL3Q8NEM8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGBL3Q8NEM8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms