Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HJURPQ8NCD3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HJURPQ8NCD3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms