Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C5orf17Q8NAS9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf17Q8NAS9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms