Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ANKRD53Q8N9V6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms