Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00612Q8N6U2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC00612Q8N6U2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC00612Q8N6U2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00612Q8N6U2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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