Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARHGEF28Q8N1W1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARHGEF28Q8N1W1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARHGEF28Q8N1W1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms