Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF2Q8IX21 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms