Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX29P2Q8IUI4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms