Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLASP1Q7Z460 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
CLASP1Q7Z460 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms