Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APTXQ7Z2E3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms