Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTF1AQ7RTS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms