Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SV2AQ7L0J3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SV2AQ7L0J3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms