Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFX8Q6ZV50 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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