Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGAP27Q6ZUM4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGAP27Q6ZUM4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms