Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM43Q6ZSC3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM43Q6ZSC3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms