Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms