Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DPPA3Q6W0C5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DPPA3Q6W0C5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms