Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP12Q6UXS9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms