Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCIMPQ6UWF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms