Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL35Q6PF15 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms