Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LLGL2Q6P1M3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LLGL2Q6P1M3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms