Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RALGAPA1Q6GYQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RALGAPA1Q6GYQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms