Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF123Q5XPI4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF123Q5XPI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms