Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf57Q5W0N0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms