Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAMD13Q5VXD3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms