Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD4Q5VX71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD4Q5VX71 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms