Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF38BQ5VTL8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms