Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP350Q5VT06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP350Q5VT06 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms