Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRIP1Q5VSL9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms