Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LDLRAD1Q5T700 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LDLRAD1Q5T700 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms