Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms