Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf220Q5T0J3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms