Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CEP170Q5SW79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CEP170Q5SW79 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms