Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms