Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 876.7 ms