Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRDTQ58F21 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRDTQ58F21 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms